甲醛的毒性體現在多個方面，會對人體健康造成嚴重危害，具體如下：
刺激作用
對黏膜的刺激：甲醛是原漿毒物質，能與蛋白質結合，對皮膚黏膜有強烈的刺激作用。當室內空氣中的甲醛濃度達到0.08 - 0.09mg/m³時，兒童可能會發生輕微氣喘；達到0.1mg/m³時，有些人就會聞到異味，身體有不適感；達到0.5mg/m³時，可刺激眼睛，引起流淚；達到0.6mg/m³時，可引起人咽喉不適或疼痛。濃度更高時，可引起惡心、嘔吐、咳嗽、胸悶、氣喘甚至肺水腫等癥狀。
對呼吸道的刺激：甲醛對呼吸道黏膜具有強烈的刺激作用，可導致黏膜充血、水腫，引發咳嗽、打噴嚏、鼻塞、咽喉疼痛等癥狀。長期接觸甲醛還會降低呼吸道的防御功能，增加呼吸道感染的風險，容易引發支氣管炎、肺炎等疾病。高濃度的甲醛吸入還可能導致急性呼吸窘迫綜合征，患者會出現呼吸困難、呼吸急促等癥狀，甚至危及生命。
對眼部的刺激：甲醛對眼睛黏膜有強烈的刺激作用，會導致結膜充血、紅腫，伴有流淚、畏光、疼痛及眼瞼水腫等癥狀。這些癥狀是眼睛對甲醛刺激的自我保護反應，試圖通過流淚沖刷掉刺激物。若甲醛濃度過高可能會出現結膜炎或角膜炎等情況，若不及時遠離甲醛環境，病情可能加重，出現角膜潰瘍或穿孔。
致敏作用
皮膚過敏：皮膚直接接觸甲醛后，可能出現干燥、瘙癢、紅腫、起紅斑、丘疹等癥狀，嚴重時可能出現水泡，甚至導致皮膚皸裂、慢性濕疹、指甲軟化等。這些癥狀是皮膚對甲醛產生的免疫反應，導致皮膚炎癥。若本身皮膚較為敏感的人群，在接觸甲醛后，過敏癥狀可能會更加嚴重。長期反復接觸甲醛，還可能導致皮膚干燥、粗糙，加速皮膚的老化進程。
呼吸道過敏：吸入高濃度甲醛時可能會誘發支氣管哮喘，對于本身患有哮喘等呼吸系統疾病的人，甲醛會加重病情，使發作更加頻繁和嚴重。
神經毒性
甲醛對神經系統有一定的毒性作用，中毒者可能出現頭暈、頭痛、乏力、失眠、記憶力減退等神經衰弱癥狀。在高濃度甲醛環境下，還可能導致抽搐、昏迷等嚴重神經系統癥狀。甲醛進入人體后，會干擾神經系統的正常功能，輕微中毒時影響日常的工作和生活，隨著中毒程度的加深，可能會出現精神抑郁、煩躁不安、意識模糊等更為嚴重的神經系統癥狀，對神經系統造成不可逆的損傷。
免疫系統影響
甲醛對免疫系統也有一定的影響，可能會導致免疫力下降，抵抗力變弱。長期暴露在甲醛環境中的人，身體抵御外界病原體的能力下降，更容易患上感冒、流感等傳染性疾病。而且，由于免疫系統功能受損，人體對腫瘤細胞的監視和清除能力也會減弱，增加了患癌的風險。
致癌風險
甲醛是明確的致癌物，長期接觸甲醛會增加患癌的幾率，特別是鼻咽癌、白血病等。研究表明，在甲醛超標的環境中工作或生活的人群，患癌風險顯著高于正常人群。大量資料記載，長期接觸低劑量甲醛可引起鼻咽癌、結腸癌、腦瘤等。甲醛還會引起一些血液系統的疾病，比如說白血病，尤其好發于青少年，因為青少年的抵抗力比較差。
